Characterizing and following eddies in Drake Passage

Drake Passage, the gap between South America and Antarctica, is a very energetic region, with strong currents and numerous eddies. These eddies are important for mixing waters across the main three fronts, and for affecting the biological productivity in the region. We use weekly maps of colour images, sea level anomaly and geostrophic velocities to characterize physical and biological activity in the region surrounding Drake Passage. In particular, we note that the largest eddy kinetic energy occurs to the east of the passage and is principally in the area bounded by the mean Subantarctic Front (SAF) and the mean Polar Front, whilst the biological productivity is highest in coastal regions, with the SAF acting as a clear southern boundary. In a number of cases, cyclonic eddies detected by altimetry also show a strong signature in ocean color. Regular XBT (eXpendable BathyThermograph) surveys provide information on sub-surface structure, confirming the altimetric identification of features and showing that they often contain water masses originating from the other side of the front

Identificación y estudio de genes simbióticos de Sinorhizobium fredii HH103 previamente no caracterizados

En la relación simbiótica que tiene lugar entre plantas leguminosas y rizobios fijadores de nitrógeno es necesaria una comunicación recíproca entre ambos organismos en la que intervienen señales químicas producidas por la planta y la bacteria. Sinorhizobium fredii HH103 es un rizobio simbionte de la soja que presenta un amplio rango de hospedador (Margaret et al., 2011; Vinardell et al., 2015). Los flavonoides exudados por la raíz de la leguminosa inducen la expresión de los genes simbióticos rizobianos a través de la activación de la proteína bacteriana NodD. La proteína reguladora NodD se expresa constitutivamente y codifica un activador transcripcional de tipo LysR que, en presencia de flavonoides específicos, reconoce y se une a nod boxes (NB), secuencias promotoras localizadas aguas arriba de los genes de nodulación, desencadenando su transcripción. Las NB controlan la expresión de genes involucrados en la producción de señales moleculares (factores Nod) necesarias para los pasos iniciales de la interacción simbiótica, así como para la transcripción del gen ttsI, cuyo producto va a reconocer y unirse a tts boxes (TB), induciendo la secreción de proteínas (efectores) a través del sistema de secreción de tipo 3 (T3SS). Estas proteínas efectoras modulan la respuesta defensiva de la planta y son importantes para determinar la compatibilidad entre ambos simbiontes. También hay varios genes de HH103 con función desconocida y cuya expresión es dependiente de NB. Además, hay grupos de genes en HH103 que se expresan diferencialmente en presencia de genisteína (flavonoide inductor de los genes de nodulación en HH103) pero que no están controlados por una NB o una TB (Pérez-Montaño et al., 2016b). Actualmente, muchos de estos genes de S. fredii HH103 ya han sido estudiados. Sin embargo, todavía hay genes simbióticos importantes que continúan sin ser caracterizados. El estudio de algunos de estos genes ha sido uno de los objetivos principales de esta Tesis para profundizar en su posible papel simbiótico y aumentar el conocimiento sobre los determinantes moleculares que permiten que esta bacteria establezca simbiosis con un elevado número de leguminosas. Más específicamente, hemos estudiado los siguientes genes: - psfHH103d_448 y psfHH103d_208 cuya expresión es controlada por la NB13 y 17, respectivamente (objetivo 1). El gen psfHH103d_448 codifica una proteína hipotética no presente en otros rizobios, incluso en otras estirpes de S. fredii. Contiene un dominio receptor, lo que sugiere su pertenencia a un sistema de dos componentes, en el que participan una proteína histidina quinasa (HK) y una proteína reguladora de respuesta (RR). La HK, regulada por un estímulo ambiental, se autofosforila en un residuo de histidina creando un grupo fosforilo altamente energético que es transferido a un residuo de aspartato en la RR. La fosforilación de esta proteína induce un cambio conformacional en su dominio regulador lo que resulta en la activación de su dominio efector desencadenando así una respuesta (Stock et al., 2000). El producto de psfHH103d_448 podría ser el componente RR, pero carece de dominio conocido de unión a ADN. El gen psfHH103d_208 codifica una proteína con un dominio conservado denominado casete de unión a ATP, lo que indica que es miembro de la familia de transportadores de tipo ABC (del inglés, ATP-binding cassette). Esta familia de transportadores comprende una superfamilia grande y diversa de transportadores de membrana que están presentes en todos los dominios de la vida. En bacterias, catalizan reacciones de transporte. Por ejemplo, la absorción de micronutrientes de alta afinidad y la exportación de compuestos citotóxicos (contribuyendo a la resistencia de la bacteria a medicamentos) (Locher, 2016). En esta Tesis hemos visto que la inactivación de cualquiera de estos dos genes no tiene efecto en la eficiencia simbiótica de HH103 con soja. - Cinco genes localizados en el plásmido simbiótico y regulados por la NB1 (objetivo 2). Esta caja controla la expresión de psfHH103d_373 a psfHH103d_370, los cuales podrían estar implicados en síntesis de triterpenoides pentacíclicos llamados hopanoides. La inactivación de sus genes ortólogos en Bradyrhizobium sp. y Bradyrhizobium diazoefficiens afecta negativamente a la supervivencia bacteriana en condiciones de estrés y a su capacidad simbiótica con sus leguminosas hospedadoras. El hecho de que en S. fredii HH103 estos genes se induzcan por flavonoides y NodD1 sugirió que los hopanoides podrían ejercer un papel protector durante la simbiosis. Sin embargo, en esta Tesis hemos visto que HH103 no produce hopanoides en presencia de flavonoides y que la inactivación de varios de estos genes tiene poco efecto en la simbiosis con soja. - Un posible operón localizado en el cromosoma y constituido por flgJ (codifica una proteína flagelar) y dos genes que codifican proteínas hipotéticas conservadas, SFHH103_00347 y SFHH103_00348 (objetivo 3). En esta Tesis hemos visto que la expresión de estos genes es dependiente de NodD1 y TtsI a través de una TB imperfecta localizada aguas arriba de flgJ, pero que su expresión también se ve ligeramente influenciada por SyrM debido a la presencia de una SyrM box (SB) también imperfecta. La inactivación de cualquiera de estos genes suprime totalmente la movilidad de tipo swimming, y en el caso de SFHH103_00347 y SFHH103_00348, también la movilidad en superficie, la cual es dependiente de genisteína en HH103. Los mutantes en flgJ y en SFHH103_00347 carecen de flagelo. La inactivación de flgJ disminuye parcialmente la movilidad en superficie indicando que, además del swarming, otros mecanismos son responsables de este tipo de movilidad. En simbiosis, la inactivación de estos genes tiene distintos efectos en función del gen mutado y de la leguminosa hospedadora estudiada. Finalmente, en trabajos previos, nuestro grupo mostró que la proteína NodD1 es el regulador principal en presencia de genisteína de la expresión génica de HH103, pero otros genes reguladores tienen un papel en la modulación de la expresión del regulón nod. El segundo objetivo principal de esta Tesis (objetivo 4) ha sido continuar con la caracterización del complejo circuito regulador que depende de flavonoides en S. fredii HH103. Para este propósito, hemos integrado los datos de RNAseq de mutantes de HH103 afectados en diferentes reguladores transcripcionales, y hemos usado métodos alternativos (qPCR, ensayos β-galactosidasa) para analizar la expresión de esos reguladores en distintas condiciones (presencia o ausencia de flavonoides, presencia o ausencia de otros reguladores). Hemos visto la importancia de los reguladores transcripcionales TtsI, NodD2, NolR y SyrM como “elementos secundarios” del regulón nod, conduciendo a un fine tuning de diferentes características bacterianas involucradas en la transición de vida libre al estado simbiótico: factores Nod y producción de exopolisacáridos, liberación de proteínas efectoras a través del T3SS simbiótico, movilidad en superficie

Development and validation of a life skills evaluation tool for online learning based on the framework of the capability approach

The promotion of life skills in learners is especially challenging in distance and online environments where the learners’ physical absence from the classroom hinders the evaluation of these types of skills. Due to the great challenges brought about by this physical absence, there is a lack of empirical studies attempting to examine life skills in web-based scenarios. This study therefore aimed to fill the existing gap in operationalizing the role of life skills for online learning through the capability approach (CA). This exploration was conducted under the umbrella of Nussbaum’s version of the CA. Specifically, our study contributes by devising an integrative and comprehensive teaching and learning framework for open educational practices based on the CA, and by introducing a new instrument that has been adapted to this context. Methodologically, the design and validation of the instrument involved a four-stage process. First, Nussbaum’s list of central human capabilities was operationalized for online learning. Then, in the second stage, a qualitative content validity check was performed to verify whether the instrument was appropriate and comprehensive in terms of what it was intended to measure. The aim of the third and fourth stages was to quantitatively assess the reliability and validity of the questionnaire. For the third stage, the instrument was pre-tested through a modified version of the Q-sort method. In the fourth stage, non-parametric tests were used to validate the internal consistency and content validity of the questionnaire. Thirty experts from the areas of online education, philosophy, and statistics took part in these stages.Financed by Beijing municipal educational science foundation No. AHDB19030.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Sinorhizobium fredii Strains HH103 and NGR234 Form Nitrogen Fixing Nodules With Diverse Wild Soybeans (Glycine soja) From Central China but Are Ineffective on Northern China Accessions

Sinorhizobium fredii indigenous populations are prevalent in provinces of Central China whereas Bradyrhizobium species (Bradyrhizobium japonicum, B. diazoefficiens, B. elkanii, and others) are more abundant in northern and southern provinces. The symbiotic properties of different soybean rhizobia have been investigated with 40 different wild soybean (Glycine soja) accessions from China, Japan, Russia, and South Korea. Bradyrhizobial strains nodulated all the wild soybeans tested, albeit efficiency of nitrogen fixation varied considerably among accessions. The symbiotic capacity of S. fredii HH103 with wild soybeans from Central China was clearly better than with the accessions found elsewhere. S. fredii NGR234, the rhizobial strain showing the broadest host range ever described, also formed nitrogen-fixing nodules with different G. soja accessions from Central China. To our knowledge, this is the first report describing an effective symbiosis between S. fredii NGR234 and G. soja. Mobilization of the S. fredii HH103 symbiotic plasmid to a NGR234 pSym-cured derivative (strain NGR234C) yielded transconjugants that formed ineffective nodules with G. max cv. Williams 82 and G. soja accession CH4. By contrast, transfer of the symbiotic plasmid pNGR234a to a pSym-cured derivative of S. fredii USDA193 generated transconjugants that effectively nodulated G. soja accession CH4 but failed to nodulate with G. max cv. Williams 82. These results indicate that intra-specific transference of the S. fredii symbiotic plasmids generates new strains with unpredictable symbiotic properties, probably due to the occurrence of new combinations of symbiotic signals.España, Junta de Andalucía P11-CVI-7500España Ministerio de Economía y Competitividad BIO2016-78409-

Correlación entre el Gasto Público en Educación y los logros de Aprendizaje de los estudiantes de nivel primario de las Instituciones Educativas pertenecientes al programa estratégico logros de Aprendizaje al finalizar el III ciclo de Educación Básica regular de la Provincia de San Martín, periodo 2009 - 2012

Education is one of the most important factors of economic growth. Certainly the public expenditure on education has generally supported by most modern societies. In Peru, spending on education is substantial and growing. So the purpose of this research is to investigate the degree of correlation between public spending on education and learning achievements under the Strategic Achievements Learning Program in the province of San Martín for the period 2009-2012. According to the technique of contrasting, this research is correlational; because it explains the relationship between the independent variable, public spending on education; and the dependent variable, learning achievement, through the coefficient of determination. For research, the scientific method was used in its analytical – synthetic form; in order to consider each document as a unit of analysis and work path synthesize information that is relevant to consider to achieve our goals. As a result there has not been found a significant correlation between public spending on education and achievement of students learning at the primary level educational institutions in the Achievements Strategic Learning Program at the end of the third cycle of Basic Education in the province of San Martín, for the study period 2009 – 2012 These findings are backed by a 95 percent confidence level and 5 percent level of significance, with probabilities of success and failure 50 percent respectively.La educación es uno de los factores más importantes del crecimiento económico. Ciertamente el gasto público en educación cuenta con el apoyo general de la mayor parte de las sociedades modernas. En el Perú, el gasto en educación es sustancial y está creciendo. Por lo que la finalidad de la siguiente investigación es investigar el grado de correlación existente entre el gasto público en educación y los logros de aprendizaje en el marco del Programa Estratégico Logros de Aprendizaje en la provincia de San Martín para el período 2009 - 2012. De acuerdo a la técnica de contrastación, esta investigación es de tipo correlacional; puesto que explica la relación existente entre la variable independiente, gasto público en educación; y la variable dependiente, logros de aprendizaje, a través del coeficiente de determinación. Para la investigación, se utilizó el método científico en su forma analítico - sintético; con el objeto de considerar a cada documento como una unidad de análisis y en el camino del trabajo sintetizar la información que es pertinente considerar para alcanzar nuestros objetivos. Como resultado no se ha encontrado una correlación significativa entre el gasto público en educación y los logros de Aprendizaje de los estudiantes de nivel primario de las instituciones educativas pertenecientes al Programa Estratégico Logros de Aprendizaje al finalizar el III ciclo de Educación Básica Regular en la provincia de San Martín, para el período de estudio 2009 - 2012. Estos hallazgos están respaldados por un 95 por ciento del nivel de confianza y 5 por ciento del nivel de significancia, con probabilidades de éxito y fracaso de 50 por ciento respectivamente.Tesi

Sinorhizobium fredii HH103 RirA is required for oxidative stress resistance and efficient symbiosis with Soybean

Members of Rhizobiaceae contain a homologue of the iron-responsive regulatory protein RirA. In different bacteria, RirA acts as a repressor of iron uptake systems under iron-replete conditions and contributes to ameliorate cell damage during oxidative stress. In Rhizobium leguminosarum and Sinorhizobium meliloti, mutations in rirA do not impair symbiotic nitrogen fixation. In this study, a rirA mutant of broad host range S. fredii HH103 has been constructed (SVQ780) and its free-living and symbiotic phenotypes evaluated. No production of siderophores could be detected in either the wild-type or SVQ780. The rirA mutant exhibited a growth advantage under iron-deficient conditions and hypersensitivity to hydrogen peroxide in iron-rich medium. Transcription of rirA in HH103 is subject to autoregulation and inactivation of the gene upregulates fbpA, a gene putatively involved in iron transport. The S. fredii rirA mutant was able to nodulate soybean plants, but symbiotic nitrogen fixation was impaired. Nodules induced by the mutant were poorly infected compared to those induced by the wild-type. Genetic complementation reversed the mutant’s hypersensitivity to H2O2, expression of fbpA, and symbiotic deficiency in soybean plants. This is the first report that demonstrates a role for RirA in the Rhizobium-legume symbiosis.Andalucian Government Grant No. P11-CVI-7500Spanish Government Grant Nos. BIO2013-42801-P and BIO2016-78409-REuropean Regional Development Funds (ERDF)VPPI (V Plan Propio de Investigación) of University of Seville

Study of numerus clausus and number of graduates in Medicine for inclusion in a planning model of training needs for medical specialists in Andalusia

Fundamentos: La planificación de las necesidades de médicos exige equilibrar la formación de nuevos graduados con los requerimientos y demanda del sistema de salud. El objetivo de este estudio fue caracterizar la evolución de los números clausus y graduados de medicina en las facultades andaluzas para su inclusión en el desarrollo de un modelo de proyección para la planificación de especialistas médicos en Andalucía. Método: Se realizó un estudio descriptivo de los números clausus del grado de Medicina y nota de admisión, número de graduados y su perfil (edad y sexo) por curso académico. Se calculó la tasa de graduación por promoción. Se trabajó con datos agregados disponibles de distintas fuentes para el periodo 2002-2015 de las 5 facultades de Medicina del Sistema Universitario Andaluz. Resultados: Los números clausus en las 5 facultades de Medicina andaluzas pasaron de 888 en el curso 2001- 2002 a 1018 en el 2014-2015. La nota media de admisión a la carrera de Medicina se situó en 12,22 (DE 0,37) con un incremento promedio interanual de 1,7%. La media de graduados por curso fue de 871 (DE 52). Se mostró el incremento en la feminización de los graduados y menor edad en la evolución de egresados por curso académico. La tasa promedio de graduación se situó en 0,98. Conclusiones: El número de graduados en medicina fue muy próximo a los valores de los números clausus y la tasa de graduación alcanzó valores cercanos a 1 en el conjunto de facultades de Medicina de Andalucía.Background: The planning of the needs of medical specialists requires to balance the new graduates training with the health system requirements and demand. The objective of the study is to characterize the numerus clausus and the number of graduates in Medicine in the Andalusian faculties for its inclusion in the development of a planning model for medical specialists in Andalusia. Method: A descriptive study was conducted, based on the numerus clausus and the admission average in the medical degree, the number of graduates and their profile (age and sex) per academic year. The graduation rate per intake was calculated. The study was carried out with aggregate data available from various sources for the period 2002-2015 from the 5 faculties of Medicine of the Andalusian University System. Results: The numerus clausus in the 5 Andalusian faculties of Medicine increased from 888 in 2001-2002 to 1018 in 2014-2015 academic year. The admission average to study Medicine was 12.22 (SD 0.37) with an annual average increase of 1.7%. The average of graduates per academic year was 871 (SD 52). An increase in the graduates’ feminization and a decline of graduation age has been shown. The graduation rate stands at 0.98. Conclusions: The number of graduates in Medicine was very close to the numerus clausus and the graduation rate values, having reached values close to 1 in all the faculties of Medicine of Andalusia

Identification of NRF2 activation as a prognostic biomarker in T-cell acute lymphoblastic leukaemia

The standard-of-care treatment of T-cell acute lymphoblastic leukaemia (T-ALL) with chemotherapy usually achieves reasonable rates of initial complete response. However, patients who relapse or do not respond to conventional therapy show dismal outcomes, with cure rates below 10% and limited therapeutic options. To ameliorate the clinical management of these patients, it is urgent to identify biomarkers able to predict their outcomes. In this work, we investigate whether NRF2 activation constitutes a biomarker with prognostic value in T-ALL. Using transcriptomic, genomic, and clinical data, we found that T-ALL patients with high NFE2L2 levels had shorter overall survival. Our results demonstrate that the PI3K-AKT-mTOR pathway is involved in the oncogenic signalling induced by NRF2 in T-ALL. Furthermore, T-ALL patients with high NFE2L2 levels displayed genetic programs of drug resistance that may be provided by NRF2-induced biosynthesis of glutathione. Altogether, our results indicate that high levels of NFE2L2 may be a predictive biomarker of poor treatment response in T-ALL patients, which would explain the poor prognosis associated with these patients. This enhanced understanding of NRF2 biology in T-ALL may allow a more refined stratification of patients and the proposal of targeted therapies, with the ultimate goal of improving the outcome of relapsed/refractory T-ALL patients.RTI2018-093330-B-I0